Будет ли штраф магазину, если продать квадрокоптер человеку без лицензии?

А при чём тут магазин и продавец? регистрировать должен владелец
покупай и регистрируй, а лицензия для продажи не требуется
и во-вторых, это самое главное- с каких пор квадрокоптер стал "гражданским воздушным судном", ты что курил?
это беспилотное воздушное судно (пункт 1 подпункт 1 ст. 33 закона)
1. государственной регистрации подлежат предназначенные для выполнения полетов следующие воздушные суда:
1) беспилотные воздушные суда, за исключением беспилотных гражданских воздушных судов с максимальной взлетной массой 30 килограммов и менее, и пилотируемые гражданские воздушные суда, за исключением сверхлегких пилотируемых гражданских воздушных судов с массой конструкции 115 килограммов и менее;