44 фз. аукцион на ремонт

Выигран аукцион кемеровской компанией на ремонт в татарстане. смету заказывал заказчик в татарстане, она была составлена в текущих ценах и некоторые позиции составлены не те, которые нужны по факту. на основании доп соглашения в новой смете изменены эти позиции на нужные, исходя из лучших характеристик, но по другим ценам (некоторые товары дороже, некоторые дешевле), при этом общая стоимость контракта осталась неизменной (о чем гласит пункт в контракте). после сдачи объекта и подписания документов с 2 сторон документы были переданы в казначейство на оплату, которое сказало, что позиции должны были быть заменены на аналогичную стоимость, что априори невозможно. вопрос: каким документом и без убытков для подрядчика разрешить эту ситуацию?