После увольнения приходят письма что мы должны выплатить агрокомплексу некую сумму

Если в суде будет доказано, что просрочка образовалась по вашей вине, например, было письменное указание об изъятии просроченного товара из зала/склада, а вы его не выполнили, то решение будет принято в пользу работодателя. при этом также должны быть оформлены надлежащим образом документы по инвентаризации у работодателя.

но, не зная всей ситуации, не представляется дать вам квалифицированный ответ, не имея полной картины происходящего.